QuantStudio 3D 数字实时 PCR
品牌:ABI/应用生物
型号:QuantStudio 3D
产地:进口
QuantStudio 3D 数字实时 PCR 系统
经济实惠、紧凑易用的数字 PCR 系统。
概述
Applied Biosystems QuantStudio 3D 数字 PCR 系统是一个简单、经济实惠的平台,采用密封芯片技术,为进行数字 PCR 提供了高效、可靠和稳定的方法。基于一站式芯片的工作流程让您可以加载芯片、密封并继续扩增。
QuantStudio 3D 系统扩展了传统实时 PCR 的界限,可以绝对定量,无需使用标准曲线。
特点
QuantStudio 3D 数字系统提供:
每个芯片20,000个纳米级反应孔 与基于液滴的方法相比,样品加载控制更佳,未完成的反应更少,从而确保绝对定量的更高精度
一次热循环多达24个芯片 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统只需不到30秒即可读取每个芯片,从而利用简单、高效的工作流程来进行数字 PCR。
基于芯片的一站式工作流程 简单的工作流程;只需加载和密封即可进行 PCR 和分析,如下所示:
样品数据
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统精度
利用 8个assay的TaqMan 基因表达Assay Panel扩增五个独立的重复。所有检测值均在相应平均值(绿线)的 ±10%(红线)范围内。(A) 低水平基因表达的结果(HPRT1、MYC 和 VEGFA)。(B) 高水平基因表达的结果(18S、B2M、GAPDH、GUSB 和 PPIA)。
QuantStudio 3D 数字 PCR 系统的准确度
经过评估,QuantStudio 3D 数字 PCR 系统绝对定量的准确度与两种正交定量方法一致。使用男性基因组 DNA,利用 QuantStudio 12K Flex OpenArray 数字 PCR 板 (OA) 上的 UV 分光光度计和数字 PCR 测定两种浓度的拷贝数/μL,并在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统 (QS3D) 上测定5个技术重复两种浓度的拷贝数/μL,然后进行对比。两种样品的预期目标浓度为300个拷贝/μL 和1,500个拷贝/μL,均在预期值范围内,而 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统得出的检测结果与其他方法相比具有极高的精度。
在9份独立 DNA 样品(相当于0–8个拷贝)中,对17号染色体上的 CCL3L1 基因位点的拷贝数分析所显示的精度和准确度。
(A) 实验设计和所检测样品组的结果数据。每个数字 PCR 检测值均落在预期值的标准差范围内。值得注意的是,所有检测值变异系数 (CV) 均小于2.55%,充分表明可以达到很高的精度。
(B) A 中所显示相同数据的图形表现。由于达到很高的精度,数字 PCR 结果可以区分出含有7个拷贝和8个拷贝的样品。
通过数字 PCR 进行 KRAS 微量等位基因定量的示例在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统上,利用针对数字 PCR 进行了优化的定制 TaqMan SNP 基因分型分析检测 KRAS G12V 突变。
每份样品的结果表示突变质粒在野生型基因组 DNA 中的比例。0.1%目标表示在野生型基因组 DNA 背景中的突变细胞系中的突变基因组 DNA。所有样品均使用配备相对定量模块的 QuantStudio 3D AnalysisSuite Cloud Software 进行分析。(A) 目标检出突变率为10%。突变检出率为10.384%,置信区间为8.235–13.076%。(B) 目标检出突变率为1%。突变检出率为1.393%,置信区间为0.772–2.507%。(C) 目标检出突变率为0.1%。突变检出率为0.142%,置信区间为0.064–0.310%。(D) 野生型对照样品。
性能数据
QuantStudio 3D 数字 PCR 仪器 |
|
读取一份样品的时间 |
约30秒 |
PCR 检测方法 |
终点 |
样品光源 |
LED |
样品检测 |
CMOS |
检测通道 |
FAM/SYBR Green、VIC、ROX |
读取器尺寸(高 x 宽 x 深) |
21 x 13.5 x 23.25 cm(8.3 x 5.3 x 9.15 英寸) |
重量 |
2.4 kg(5.3磅) |
QuantStudio 3D 数字 PCR 20K 芯片 |
|
分区 |
芯片反应孔 |
每个芯片的样品 |
1 |
每个芯片的目标 |
2 |
热循环仪中的芯片容量 |
24 |
每份样品的反应孔 |
20,000 |
加载体积 |
14.5 μL |
密封工作流程 |
是 |
性能 |
|
动态范围 |
5个对数级 |
95%置信区间的精度 |
±10% |
兼容的化学品 |
TaqMan 和 SYBR Green 化学品 |